具有特定热性质蛋白质的设计
凝聚态物理
2007-05-23 v1 q-bio
摘要
我们提出了一种新的有效方法,利用分子配分函数的累积量展开来设计稳定且快速折叠的多肽序列。该方法的独特之处在于,,即“累积量设计温度”,作为设计过程中的一个参数输入,预计也是最佳折叠温度。该方法通过在不同折叠温度下对设计序列进行蒙特卡洛折叠模拟进行了测试。(折叠模拟在立方格点上进行以方便计算,但设计过程本身与格点无关。)模拟证实,在广泛的范围内,当时,所有设计序列都能快速折叠。此外,仅通过使用高进行设计,就创建了高度热稳定的模型蛋白质。这些研究中提出的机制为生物活性蛋白质的进化设计提供了合理的途径,这些蛋白质{\em 必须}在相对狭窄的温度范围内折叠并保持稳定。
引用
@article{arxiv.cond-mat/9601120,
title = {Design of Proteins with Specified Thermal Properties},
author = {Michael P. Morrissey and Eugene I. Shakhnovich},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9601120},
year = {2007}
}
备注
12 pages (RevTeX) + 4 postscript figures