化学计量网络的变形环面理想约束
分子网络
2013-04-24 v2 定量方法
摘要
我们基于化学计量网络分析讨论了化学反应网络和代谢途径，并通过代数几何方法引入了变形环面理想约束。本文关注化学反应网络和代谢途径的稳态通量。利用变形环面理想约束，极值途径的线性组合参数自动受到约束，无需引入临时约束。为了说明这种约束的有效性，我们讨论了化学反应网络和代谢途径的两个例子；在前者中，通量和浓度完全由变形环面理想约束所约束，而在后者中，表明变形环面理想至少部分地约束了通量的线性组合参数。即使在后者情况下，加上酶总量恒定的附加约束，通量和浓度也完全被约束。
引用
@article{arxiv.1202.5092,
title = {Deformed Toric Ideal Constraints for Stoichiometric Networks},
author = {Masamichi Sato and Kenji Fukumizu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1202.5092},
year = {2013}
}