跨药物与膜的药物-膜渗透性数据驱动方程
化学物理
2021-06-30 v3 软凝聚态物质
摘要
药物疗效取决于其穿透细胞膜的能力。我们考虑被动药物-膜渗透系数的预测。除广泛认可的与疏水性的相关性外，我们还额外考虑了被动渗透与酸度之间的函数关系。为发现能很好解释数据且易于解释的方程，我们使用最近提出的确定性独立筛选与稀疏化算子（SISSO），一种将符号回归与压缩感知相结合的AI技术。我们的研究基于从粗粒化模拟中提取的包含 40 万个小分子的庞大数据集。我们通过分析若干渐近酸度区间下的非均匀溶解-扩散模型，对 SISSO 建议的方程给出理论依据。我们进一步将分析扩展到对脂质膜组成的依赖性。脂质尾不饱和度起着关键作用，但令人惊讶地是呈阶梯式而非比例式贡献。我们的结果与先前观察到的渗透性变化一致，提示了液态无序（Ld）与液态有序（Lo）渗透之间的区别。总之，压缩感知与解析导出的渐近线确立并验证了一个准确、广泛适用且可解释的、跨药物与脂质尾化学的被动渗透方程。
引用
@article{arxiv.2012.01766,
title = {Data-driven equation for drug-membrane permeability across drugs and membranes},
author = {Arghya Dutta and Jilles Vreeken and Luca M. Ghiringhelli and Tristan Bereau},
journal= {arXiv preprint arXiv:2012.01766},
year = {2021}
}
备注
11 pages, 7 figures