微溶剂化环境下 Cu2+ -- 苯丙氨酸复合物的 CPMD 模拟
化学物理
2013-05-24 v1
摘要
本研究结合 DFT 计算和 CPMD 模拟,研究了苯丙氨酸 - 铜 (II) ([Phe-Cu]2+) 复合物的结构及其微溶剂化过程。研究发现,苯丙氨酸部分在孤立和单水合复合物中呈中性形式,但在其他水合复合物(水分子数)中呈两性离子形式。当前的 CPMD 模拟表明,在 Phe 配体存在下,Cu2+ 的最大配位数不超过四:即来自三个水分子的氧原子和来自 Phe 的一个羧基氧原子。任何多余的水分子都将迁移至第二溶剂化层。此外,在能量最低的复合物中存在一种独特的结构基序,该基序被认为对稳定复合物结构具有重要意义。
引用
@article{arxiv.1305.5288,
title = {CPMD simulation of Cu2+ -- phenylalanine complex under micro-solvated environment},
author = {Aravindhan Ganesan and Jens Dreyer and Feng Wang and Jaakko Akola and Julen Larrucea},
journal= {arXiv preprint arXiv:1305.5288},
year = {2013}
}
备注
28 pages, 3 tables and 4 figures