CoV-Spectrum：分析全球共享 SARS-CoV-2 数据以识别与表征新变异株
种群与进化
2021-12-28 v2
摘要
摘要：CoV-Spectrum 网站支持识别新的值得关注 SARS-CoV-2 变异株并追踪已知变异株。其灵活的氨基酸与核苷酸突变搜索允许在变异株被谱系命名系统指定之前进行查询。该平台汇集来自不同来源的 SARS-CoV-2 数据并进行分析。结果包括不同变异株随时间的比例、其人口与地理分布、常见突变、住院与死亡概率、传播适应度优势估计，以及从废水样本获得的见解。可用性与实现：CoV-Spectrum 可在 https://cov-spectrum.ethz.ch 访问。代码以 GPL-3.0 许可证发布于 https://github.com/cevo-public/cov-spectrum-website。
引用
@article{arxiv.2106.08106,
title = {CoV-Spectrum: Analysis of globally shared SARS-CoV-2 data to Identify and Characterize New Variants},
author = {Chaoran Chen and Sarah Nadeau and Michael Yared and Philippe Voinov and Ning Xie and Cornelius Roemer and Tanja Stadler},
journal= {arXiv preprint arXiv:2106.08106},
year = {2021}
}