追踪 SARS-CoV-2 演化中的统计挑战
应用统计
2021-08-31 v1 种群与进化
摘要
SARS-CoV-2 的基因组监测在疫情期间追踪病毒传播与演化方面发挥了关键作用。从感染者分离的 SARS-CoV-2 分子序列的可用性，结合系统发育动力学方法，已为病毒起源、演化速率、传入时间、传播模式以及已在人群中传播的新变异株的兴起提供了见解。尽管政府、实验室和研究人员为收集和测序分子数据作出了巨大的全球努力，在分析解读所收集数据方面仍存在诸多挑战。在此，我们描述当前用于监测 SARS-CoV-2 传播的模型与方法，讨论长期存在与新出现的统计挑战，并提出一种在疫情期间追踪新变异株兴起的方法。
引用
@article{arxiv.2108.13362,
title = {Statistical Challenges in Tracking the Evolution of SARS-CoV-2},
author = {Lorenzo Cappello and Jaehee Kim and Sifan Liu and Julia A. Palacios},
journal= {arXiv preprint arXiv:2108.13362},
year = {2021}
}