CRISPR 间隔区获取的代价与收益
种群与进化
2018-11-12 v1 生物物理
摘要
细菌中 CRISPR-Cas 介导的免疫使细菌种群能够保护自身免受病原体侵害。然而，它也通过产生靶向自身基因组的保护使细菌面临自身免疫的危险。利用一个噬菌体与细菌种群耦合动力学的简单模型，我们探究了获取速率如何影响细菌菌落的存活率。我们发现最优策略依赖于病毒与细菌两者的初始种群规模。此外，由于演化种群规模间的动态平衡，某些获取速率、动态速率与初始种群规模的组合可在不依赖病毒间隔区获取的情况下保证保护。在此机制之外，自身免疫的高代价限制了获取速率。我们结合近期实验讨论了这些最优生存策略。
引用
@article{arxiv.1811.03674,
title = {Cost and benefits of CRISPR spacer acquisition},
author = {Serena Bradde and Thierry Mora and Aleksandra M. Walczak},
journal= {arXiv preprint arXiv:1811.03674},
year = {2018}
}
备注
5 figures, 10 pages