中文

计算机辅助疫苗设计

种群与进化 2009-05-28 v2

摘要

我们定义了一个新参数来量化两种H3N2流感毒株之间的抗原距离:利用该参数测量流行H3N2毒株与流感疫苗中最接近的疫苗组分之间的抗原距离。对于1971年至2004年的数据,该抗原距离度量与H3N2甲型流感年度疫苗在人体中的效力相关性,优于当前最先进的抗原距离度量方法,如系统发育序列分析或雪貂抗血清抑制试验。我们建议,该抗原距离度量可用于指导年度流感疫苗的设计。我们将抗原距离度量与多毒株禽流感传播模型相结合,以研究多种禽流感毒株同时传入的威胁。对于H3N2流感,该模型根据世界卫生组织FluNet全球流感监测网络观测到的病毒固定率和流行进展率进行了验证。我们发现,多组分禽流感疫苗有助于控制禽流感毒株的同时多重传入。我们引入“风险人群”(PaR)来量化流感大流行的风险,并通过该指标计算多组分疫苗所带来的改善。

关键词

引用

@article{arxiv.0904.4705,
  title  = {Computer-assisted vaccine design},
  author = {Rao Zhou and Ramdas S. Pophale and Michael W. Deem},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0904.4705},
  year   = {2009}
}

备注

25 pages; 5 figures; 1 table; to appear in Influenza: Molecular Virology, Horizon Scientific Press, edited by Qinghua Wang and Yizhi Jane Tao, 2009