束缚与自由条件下小分子结合的计算研究
生物物理
2009-12-14 v1 化学物理
摘要
使用杯[4]芳烃-苯复合物作为测试系统，我们比较了杯[4]芳烃在束缚与自由条件下的平均力势。当复合物处于真空中时，我们的结果表明，束缚与自由之间的差异主要归因于平均力势的熵贡献，导致结合自由能差为 6.5 kJ/mol。相比之下，当复合物处于水中时，我们的结果表明，束缚与自由之间的差异归因于焓贡献，导致结合自由能差为 1.6 kJ/mol。本研究阐明了熵和焓在该小分子系统中的作用，并强调了束缚受体有可能显著影响结合特性这一观点。在设计纳米传感器使用杯芳烃分子时，应考虑这些发现。
引用
@article{arxiv.0912.2136,
title = {Computational study of small molecule binding for both tethered and free conditions},
author = {F. Marty Ytreberg},
journal= {arXiv preprint arXiv:0912.2136},
year = {2009}
}
备注
4 pages, 2 figures