拴珠实验中的排除体积效应:珠子尺寸至关重要
生物大分子
2009-11-11 v2
摘要
拴珠法是一种单分子技术,已用于探索多种具生物学意义的大分子动力学。我们对此类实验中粒子运动给出理论分析。我们的分析揭示,拴系珠子邻近表面(显微镜载玻片)会产生体积排除效应,导致作用于分子的熵力。该力拉伸分子,改变其统计性质。特别地,珠子与表面的邻近带来关键可观测量(珠子的统计矩)与珠子尺寸及分子轮廓长度等参数之间有趣的标度关系。我们给出柔性及半柔性拴系中这些效应的近似解析解与数值结果。最后,我们的结果精确给出了可实验检验的聚合物附着点与活动珠子中心距离概率分布预测。
引用
@article{arxiv.q-bio/0508028,
title = {Excluded-Volume Effects in Tethered-Particle Experiments: Bead Size Matters},
author = {Darren E. Segall and Phillip C. Nelson and Rob Phillips},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0508028},
year = {2009}
}
备注
4 pages, 3 figures