聚合物链两端之间平均首次相遇时间的计算
统计力学
2013-12-23 v1
摘要
使用一种新颖的理论方法，我们研究了聚合物链两端之间的平均首次相遇时间（MFET）。先前的方法使用了各种简化来降低问题的复杂性，但导致了不一致的结果。我们首次构建了一个通用理论，使我们能够计算MFET。该方法基于估计布朗粒子到达聚合物构型空间中狭窄域的平均时间。在二维和三维中，我们发现MFET主要依赖于相关Fokker-Planck算子的第一特征值，并提供了精确估计，这些估计得到了布朗模拟的证实。有趣的是，尽管相遇过程涉及许多时间尺度，但其分布可以很好地近似为单指数分布，这对模拟细胞核中的染色体动力学具有若干意义。我们结果的另一个应用是计算DNA分子形成闭合环（当其两端首次相遇时）的平均时间。
引用
@article{arxiv.1312.6041,
title = {Computation of the Mean First-Encounter Time Between the Ends of a Polymer Chain},
author = {Assaf Amitai and Ivan Kupka and David Holcman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1312.6041},
year = {2013}
}