细胞身份的集体特性：一种计算方法

细胞类型（例如多能细胞、成纤维细胞）是许多复杂过程的最终结果，这些过程由进化、发育和转化刺激所展开。细胞的表型以及定义各种细胞亚型（例如皮肤成纤维细胞、胚胎干细胞）的离散先验状态，最终构成了一个连续体，可以预测细胞亚型的变化和系统性变异。这些特征既可以在现有细胞状态中观察到，也可以是假设性的（例如未观察到的）。在本文中，将使用一系列方法来近似多能、全能和成纤维细胞亚型系列中基因表达的连续多样性。我们将使用一系列先前收集的数据集，并利用三种互补方法进行分析：基于多样性子采样的距离计算、评估特定细胞系内及细胞类型间单个基因的可分离性，以及一种分层软分类技术，该技术将根据多种标准为特定细胞类型中的特定基因分配隶属度值。这些方法将使我们能够评估这些数据集中观察到的基因表达多样性，并评估先验细胞类型对其组成群体的表征程度。最后，将讨论这些发现于更广泛生物学背景中的应用。