HIV序列中的密码子偏好与可变性
adap-org
2008-02-03 v1 适应与自组织系统
q-bio
摘要
对HIV env基因中同义密码子偏好模式的调查揭示了密码子偏好与不同蛋白区域中可变性要求之间的关系。在gp120的高变区域，发现更大比例的密码子倾向于进行非同义突变，但靶向在亲水性和体积上相似。我们认为，这种策略是由于诱导的免疫反应对HIV所施加的选择压力，这种压力倾向于在补等位区进行氨基酸突变，而对于违反env蛋白结构约束的错义突变则受到负选择所致。
引用
@article{arxiv.adap-org/9708003,
title = {Codon Bias and Mutability in HIV Sequences},
author = {H. Waelbroeck},
journal= {arXiv preprint arXiv:adap-org/9708003},
year = {2008}
}
备注
TeX source, 29 p., please email author for figures