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抓得住我吗:一种由制动驱动的基因驱动逆转的空间模型

偏微分方程分析 2019-07-15 v2

摘要

利用人工基因驱动(使等位基因偏向遗传、增加其向后代传递的自身传递概率)进行种群管理,随着CRISPR-Cas基因工程的发展正成为一种现实可能。然而,基因驱动可能必须被阻止。已有学者提出“解药”(制动),但迄今为止仅在充分混合种群中研究过。在此,我们考虑一个反应—扩散系统,模拟在野生型种群(适应度1)中释放基因驱动(适应度1-a)与制动(适应度1-b,b≤a)。我们证明,只要驱动适应度至多为1/2且制动适应度接近1,长期来看制动与驱动将共同灭绝。相反,若驱动适应度大于1/2,则共同灭绝不可能发生:驱动与制动持续空间扩散,在入侵尾迹中留下复杂的时空异质遗传模式。基于数值实验,我们主张一个全局共同灭绝猜想:只要驱动适应度至多为1/2,无论制动适应度如何,均成立。证明依赖于对一个相关捕食者—猎物系统的研究,其中猎物具有强Allee效应。我们的结果表明,某些驱动可能无法阻止;并且,如果基因驱动 ever 被部署于自然中,应优先选择阈值驱动——即仅以足够高频率引入时才会扩散的驱动。

关键词

引用

@article{arxiv.1812.06641,
  title  = {Catch me if you can: a spatial model for a brake-driven gene drive reversal},
  author = {Léo Girardin and Vincent Calvez and Florence Débarre},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1812.06641},
  year   = {2019}
}