CARTEpigenoQC：CAR-T单细胞表观基因组数据质量控制工具包

CARTEpigenoQC是一个基于R的工具包，旨在简化涉及嵌合抗原受体（CAR）工程化T细胞的单细胞表观基因组数据集的质量控制（QC）。随着scATAC-seq、scCUT&Tag和scBS-seq在表征CAR-T细胞状态方面的应用日益广泛，执行定制化的QC变得至关重要，这种QC不仅要处理标准指标，如FRiP（峰内读取片段比例）和TSS富集度，还要直接检测来自CAR载体插入位点的信号。CARTEpigenoQC支持10x Genomics和非10x数据格式，并生成适用于探索性分析和监管级临床前报告的HTML和PNG摘要输出。它旨在帮助研究人员、核心设施和转化免疫学家确保工程化T细胞单细胞表观基因组分析的有效性。