DNA 基因启动子中的气泡寿命及其影响转录的突变
生物大分子
2021-09-15 v1
摘要
在 Peyrard-Bishop-Dauxois 模型框架下，给出了不同基因启动子及相应突变体（其转录活性升高或降低）中长度可达十个碱基对的内在双链 DNA 开口的相对寿命。使用了广泛的微正则模拟，能量对应生理温度。沿 DNA 序列的气泡寿命分布显示，当突变启动子降低转录时，突变位点的平均寿命显著减少，而在导致转录增强的突变情况下，观察到气泡寿命的相应延长。在突变位置处突变体与野生型启动子之间气泡寿命的相对差异，随着气泡长度的减小从 20% 变化到超过 30%。
引用
@article{arxiv.2106.15244,
title = {Bubble lifetimes in DNA gene promoters and their mutations affecting transcription},
author = {M Hillebrand and G Kalosakas and A R Bishop and Ch Skokos},
journal= {arXiv preprint arXiv:2106.15244},
year = {2021}
}
备注
6 pages, 4 figures