BioTD：生物毒素在线数据库
生物大分子
2024-12-31 v1
摘要
生物毒素主要由毒性动物、植物和微生物产生，具有高度生理活性和独特作用，如降低血压和止痛。已有许多从毒素衍生的药物在市场上投放使用，而更多候选药物正在进行临床和实验室研究。然而，与生物毒素相关的药物设计资源不足，尤其缺乏准确且广泛的活性数据。为满足这一需求，我们开发了生物毒素数据库（BioTD）。BioTD是目前最大的开放性毒素数据库，提供14,607条数据记录（包括8,185条活性记录），覆盖来自5,220篇文献和专利的8,975种毒素，涵盖超过900种物种。BioTD中的活性数据分为五大类：活性、安全性、动力学、血小板溶解和其他生理指标。此外，BioTD提供986个突变体的数据，细化了毒素的整个序列和信号肽序列，并标注了二硫键信息。鉴于生物毒素及其关联数据的重要性，本新数据库预计将吸引来自药物发现不同领域的广泛关注。BioTD可在http://biotoxin.net/上免费访问。
引用
@article{arxiv.2412.20038,
title = {BioTD: an online database of biotoxins},
author = {Gaoang Wang and Hang Wu and Yang Liao and Zhen Chen and Qing Zhou and Wenxing Wang and Yifei Liu and Yilin Wang and Meijing Wu and Ruiqi Xiang and Yuntao Yu and Xi Zhou and Feng Zhu and Zhonghua Liu and Tingjun Hou},
journal= {arXiv preprint arXiv:2412.20038},
year = {2024}
}