生物医学知识图谱：领域、任务与实际应用综述
计算与语言
2025-01-23 v2 人工智能
计算工程、金融与科学
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摘要
生物医学知识图谱(BKG)已成为组织和利用生物医学领域广泛且复杂数据的强大工具。然而，当前的BKG综述常将范围限制于特定领域或方法，忽视了更广阔的格局以及快速变靡的技术进程。本综述通过三个核心视角(领域、任务、应用)来填补这一差距，提供了系统性的BKG综述。我们首先审查了从分子相互作用、药理数据集和临床记录等多样数据源构建BKG的方式。接着，我们讨论了BKG所能实现的关键任务，专注于知识管理、检索、推理和解释。最后，我们突出展示了在精准医学、药物发现和科学研究中的实际应用，阐明了BKG在多个部门的转化性影响。通过将这些视角整合为统一框架，本综述不仅澄清了BKG研究的当前状态，也为未来探索奠定了基础，使创新方法论的进步和实际实施成为可能。
引用
@article{arxiv.2501.11632,
title = {Biomedical Knowledge Graph: A Survey of Domains, Tasks, and Real-World Applications},
author = {Yuxing Lu and Sin Yee Goi and Xukai Zhao and Jinzhuo Wang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2501.11632},
year = {2025}
}
备注
45 pages, 4 figures, 3 tables. Updated figures