用于加速生化发现的信息抽取与知识图谱平台

Matteo Manica; Christoph Auer; Valery Weber; Federico Zipoli; Michele Dolfi; Peter Staar; Teodoro Laino; Costas Bekas; Akihiro Fujita; Hiroki Toda; Shuichi Hirose; Yasumitsu Orii

用于加速生化发现的信息抽取与知识图谱平台

信息检索 2019-07-22 v1 机器学习

作者: Matteo Manica , Christoph Auer , Valery Weber , Federico Zipoli , Michele Dolfi , Peter Staar , Teodoro Laino , Costas Bekas , Akihiro Fujita , Hiroki Toda , Shuichi Hirose , Yasumitsu Orii

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摘要

生化文献中的信息抽取与数据挖掘是一项艰巨任务，需要资源密集型计算以及适当手段来扩展知识摄取。能够利用这一巨大的技术信息源，有助于在从食品安全到制药的多个应用领域中大幅降低成本和缩短解决时间。我们提出一个可扩展的文档摄取系统，将来自数据库与出版物（PDF 格式）的数据整合到生化知识图谱（BCKG）中。BCKG 是一个全面的知识源，可经查询以检索已知生化事实并生成新颖见解。在描述知识摄取框架后，我们展示了我们的系统在糖酶领域的应用。BCKG 代表了一种扩展知识摄取并自动利用先验知识以加速生化科学发现的方式。

关键词

信息抽取知识图谱生化文献文档摄取糖酶数据挖掘

引用

@article{arxiv.1907.08400,
  title  = {An Information Extraction and Knowledge Graph Platform for Accelerating Biochemical Discoveries},
  author = {Matteo Manica and Christoph Auer and Valery Weber and Federico Zipoli and Michele Dolfi and Peter Staar and Teodoro Laino and Costas Bekas and Akihiro Fujita and Hiroki Toda and Shuichi Hirose and Yasumitsu Orii},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1907.08400},
  year   = {2019}
}

备注

4 pages, 1 figure, Workshop on Applied Data Science for Healthcare at KDD, Anchorage, AK, 2019

用于加速生化发现的信息抽取与知识图谱平台

摘要

关键词

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