超越外显子组：孟德尔疾病诊断检测的下一步
基因组学
2024-02-28 v1
摘要
尽管临床基因检测取得了进展，包括外显子组测序（ES）的引入，但超过 50% 疑似孟德尔疾病个体仍缺乏精确分子诊断。临床评估日益由临床遗传学以外的专家开展，常以分层方式进行并通常在 ES 后终止。当前的诊断率反映了多重因素，包括技术局限、对变异致病性理解不全、基因型-表型关联缺失、复杂的基因-环境相互作用，以及临床实验室间报告差异。对非遗传学专业人员而言，清晰理解 ES 之外快速演进的诊断检测格局及其局限是一项挑战。较新的检测如短读长基因组或 RNA 测序可能难以开具，而新兴技术如光学基因组作图与长读长 DNA 或 RNA 测序尚未进入临床。此外，对于评估无结论后的下一步最佳方案缺乏明确指导。在此，我们回顾临床遗传评估可能为阴性的原因，探讨此种情形下应提出的问题，并提供进一步调查的框架，包括临床领域新兴方法的优劣。我们基于表型与既往评估给出了分子检测无结论后的下一步指南，包括何时考虑转诊至如 GREGoR 等联盟，该联盟致力于阐明罕见未解遗传疾病的潜在病因。
引用
@article{arxiv.2301.07363,
title = {Beyond the exome: what's next in diagnostic testing for Mendelian conditions},
author = {Monica H. Wojcik and Chloe M. Reuter and Shruti Marwaha and Medhat Mahmoud and Michael H. Duyzend and Hayk Barseghyan and Bo Yuan and Philip M. Boone and Emily E. Groopman and Emmanuèle C. Délot and Deepti Jain and Alba Sanchis-Juan and Genomics Research to Elucidate the Genetics of Rare Diseases and Consortium and Lea M. Starita and Michael Talkowski and Stephen B. Montgomery and Michael J. Bamshad and Jessica X. Chong and Matthew T. Wheeler and Seth I. Berger and Anne O'Donnell-Luria and Fritz J. Sedlazeck and Danny E. Miller},
journal= {arXiv preprint arXiv:2301.07363},
year = {2024}
}