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可逆自由连接链的弯曲弹性

软凝聚态物质 2025-01-06 v2 生物物理

摘要

具有可逆铰链的自由连接链模型(rFJC)是最简单的理论模型,能够捕捉聚合物主链上局部弯曲刚度的可逆转变,例如螺旋-线圈型的局部构象变化或配体结合/解离引起的变化。在本工作中,我们分析了在吉布斯(恒力)系综中嫁接的 rFJC 的弯曲涨落和弯曲响应。我们得到了嫁接 rFJC 在弯曲力作用下的配分函数的递推关系,这使得原则上可以对任意尺寸的 rFJC 进行精确数值计算。与拉伸不同,我们证明在足够刚硬的条件下,微分弯曲柔顺性和闭合铰链的平均比例是力的非单调函数。我们还获得了 rFJC 的持久长度 LpL_p、矩 R2\langle R^2 \rangle(均方末端距)和 z2\langle z^2 \rangle(均方横向偏移),并对离散链取连续极限。切向量自相关呈指数衰减,与蠕虫状链模型(WLC)相同。值得注意的是,R2\langle R^2 \rangle 作为轮廓长度 LL 的函数表达式变得与 WLC 中的相同。在热力学极限下,我们解析地计算了精确的弯曲响应。正如预期的那样,当 LLpL\gg L_p 时,边界条件不再重要,弯曲等价于拉伸。相反,当 LpLL_p\gg L 时,我们展示了弯曲响应(柔顺性和闭合铰链的平均比例)的非单调性。

关键词

引用

@article{arxiv.2411.05347,
  title  = {Bending Elasticity of the reversible Freely Jointed Chain},
  author = {Minsu Yi and Dongju Lee and Panayotis Benetatos},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2411.05347},
  year   = {2025}
}

备注

Submitted to The Journal of Chemical Physics. Published on December 19