利用已知结构蛋白的残余偶极耦合实现主链共振的自动归属
生物大分子
2019-11-05 v1 计算机视觉与模式识别
摘要
共振归属是利用 NMR 光谱研究蛋白质结构的关键首要步骤。在具备大分子结构先验知识的情况下，开发需要更少实验数据的归属方法是可行的。执行共振归属任务的自动化方法可显著降低蛋白质结构测定的经济成本与时间需求。此类方法亦有益于验证蛋白质的溶液态结构。此处我们提出一种处理归属问题的新途径。我们的方法仅使用 RDC 数据来归属主链共振，它提供序张量估计与归属的同步进行。我们的方法比较独立的序张量估计，以判定何时找到了正确的序张量。我们利用来自蛋白质结构域 1A1Z 的模拟数据证明了该算法的可行性。
引用
@article{arxiv.1911.00526,
title = {Automated Assignment of Backbone Resonances Using Residual Dipolar Couplings Acquired from a Protein with Known Structure},
author = {P. Shealy and R. Mukhopadhyay and S. Smith and H. Valafar},
journal= {arXiv preprint arXiv:1911.00526},
year = {2019}
}
备注
BioComp 2008, 7 pages