用于神经重建的不完美电镜图像自动对齐
定量方法
2013-04-23 v1
摘要
从动物体内重建神经回路最成熟的方法是将组织切得非常薄，然后拍摄电子显微镜 (EM) 图像的镶嵌图。为了在不同图像之间以及不同切片之间追踪神经元，必须准确对齐这些图像，既要与同一切片内的其他图像对齐，也要与上下切片对齐。不幸的是，切片和成像并非理想过程——使对齐变得困难的问题包括透镜畸变、成像过程中的组织收缩、切片组织中的撕裂和折叠，以及灰尘和其他伪影。此外，数据集庞大（数十万张图像），且每张图像必须与许多邻居对齐，因此该过程必须是自动化且可靠的。本文讨论了处理这些问题的方法，并提供了描述所得对齐精度的数值结果。
引用
@article{arxiv.1304.6034,
title = {Automated Alignment of Imperfect EM Images for Neural Reconstruction},
author = {Louis K. Scheffer and Bill Karsh and Shiv Vitaladevun},
journal= {arXiv preprint arXiv:1304.6034},
year = {2013}
}
备注
23 pages, 10 figures