含假结 RNA 结构的渐近计数
生物大分子
2009-09-29 v1 组合数学
摘要
在本文中,我们给出了含假结 RNA 结构的渐近计数。我们开发了一个通用框架,用于计算 -非交叉 RNA 结构的指数增长率和次指数因子。我们的结果基于在 \cite{Reidys:07pseu} 中导出的 -非交叉 RNA 假结结构数量 的生成函数,其中 表示相互交叉键集的最大尺寸。我们证明了生成函数 的泛函方程,并分别获得了 和 的解析延拓和奇点展开。我们的结果隐含了对于任意 奇点展开都存在,并且通过解析组合学的转移定理,我们获得了系数的渐近表达式。我们显式推导了 2-和 3-非交叉 RNA 结构的渐近表达式。我们的主要结果是推导出了公式 。
引用
@article{arxiv.0706.3137,
title = {Asymptotic Enumeration of RNA Structures with Pseudoknots},
author = {Emma Y. Jin and Christian M. Reidys},
journal= {arXiv preprint arXiv:0706.3137},
year = {2009}
}
备注
22 pages, 7 figures