人胰岛淀粉样多肽结构景观的若干方面
生物大分子
2015-06-23 v1 软凝聚态物质
斑图形成与孤子
医学物理
摘要
人胰岛淀粉样多肽 (hIAPP) 与胰岛素协同维持血糖平衡，同时也构成了 II 型糖尿病患者胰腺中聚集的淀粉样斑块。我们进行了广泛的计算机模拟研究，以分析单体 hIAPP 的结构景观，该单体被认为具有内在无序性。为此，我们从第一性原理出发构建了一个高度预测性的能量函数，将核磁共振 (NMR) 实验中观测到的单体 hIAPP 描述为一个局部能量极小值。我们将 hIAPP 的理论模型置于反复的加热和冷却模拟中，使其在高温区（构象类似随机行走者）与低温极限（无热运动）之间往复变化。我们发现，最终的低温构象表现出高度的简并性，这与 hIAPP presumed 的内在无序特征完全一致。特别是，我们识别出一个孤立的α-螺旋构象家族，其可能通过成核作用引发向淀粉样变性的转变。
引用
@article{arxiv.1412.7972,
title = {Aspects of structural landscape of human islet amyloid polypeptide},
author = {Jianfeng He and Jin Dai and Jing Li and Xubiao Peng and Antti J. Niemi},
journal= {arXiv preprint arXiv:1412.7972},
year = {2015}
}