基于基因间区信息的加权翻转、转置与删除距离问题的近似算法
数据结构与算法
2026-01-01 v1
摘要
基因重排距离是基因比较中已确立的方法。该领域的研究可能包括各种表示大规模突变的重排操作、基因方向信息、基因间区核苷酸数目以及反映每种操作发生频率的权重。在本文中，我们通过考虑包含最多一个基因拷贝的基因组、包含方向信息的基因序列来建模基因组，并根据核苷酸长度表示基因间区。我们研究了一个称为加权翻转、转置与删除距离问题的任务，该任务寻求由由翻转、转置和删除操作组成的最小成本序列，能够将一个基因组转换为另一个基因组。我们利用一种称为 Labeled Intergenic Breakpoint Graph 的结构，展示了一个针对该问题具有保证近似性质的算法，适用于某些操作权重集合。
引用
@article{arxiv.2512.25016,
title = {Approximations for the Weighted Reversal, Transposition, and Indel Distance Problem with Intergenic Region Information},
author = {Gabriel Siqueira and Alexsandro Oliveira Alexandrino and Zanoni Dias},
journal= {arXiv preprint arXiv:2512.25016},
year = {2026}
}