使用系统发育方法对六足动物miRNA的分析研究
计算工程、金融与科学
2012-05-24 v1 基因组学
摘要
MicroRNAs（miRNA）是一类调控基因表达的非编码RNA。即使在完全测序的生物体中，识别miRNA的总数仍然是一个未解决的问题。然而，研究人员一直在使用能够预测生物体中有限数量miRNA的技术。本文采用基于同源性的方法对六足动物群的miRNA进行比较分析。我们使用了来自miRBase数据库的意大利蜜蜂（Apis mellifera）、家蚕（Bombyx mori）、冈比亚按蚊（Anopholes gambiae）和黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）的miRNA数据集。我们对数据库中现有的miRNA进行了成对和多序列比对，以识别和分析相关物种间的保守区域。遗憾的是，据我们所知，与miRNA相关的文献并未对六足动物进行深入分析。我们尝试推导miRNA之间的共性，并识别miRNA数据库中尚未提供的保守区域。结果近似良好，仅有少量错配。然而，这些结果是令人鼓舞的，可能有助于miRNA的生物发生。
引用
@article{arxiv.1205.5024,
title = {Analytical Study of Hexapod miRNAs using Phylogenetic Methods},
author = {A. K. Mishra and H. Chandrasekharan},
journal= {arXiv preprint arXiv:1205.5024},
year = {2012}
}