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可逆双分子反应的布朗动力学模拟分析

生物物理 2010-05-12 v1 化学物理定量方法

作者: J. Lipkova , K. C. Zygalakis , S. J. Chapman , R. Erban

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摘要

本文提出并分析了一类包含可逆双分子反应的随机反应扩散模型的布朗动力学算法。该方法是[arXiv:0903.1298]中针对不可逆双分子反应引入的 $\lambda$ -- $\newrho$ 模型的推广。推导了实验可测量量（反应速率常数和扩散常数）与算法参数之间的关系式。还研究了成对复合的概率。

关键词

布朗动力学可逆双分子反应随机反应扩散模型 lambda-rho模型成对复合反应速率常数

引用

@article{arxiv.1005.0698,
  title  = {Analysis of Brownian Dynamics Simulations of Reversible Bimolecular Reactions},
  author = {J. Lipkova and K. C. Zygalakis and S. J. Chapman and R. Erban},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1005.0698},
  year   = {2010}
}

备注

16 pages, 13 figures, submitted to SIAM Appl Math