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近期人工智能在药物设计中的应用深度综述

定量方法 2021-10-13 v1 人工智能 机器学习

摘要

作为在广阔化学空间中导航的一种有前景的工具,人工智能(AI)被应用于药物设计。从2017年到2021年,若干近期AI模型(即图神经网络(GNN)、循环神经网络(RNN)、变分自编码器(VAE)、生成对抗网络(GAN)、流模型与强化学习(RL))在药物设计中的应用数量显著增加。已有许多相关文献综述,然而它们均未对近期AI模型在药物设计中的诸多应用提供深入总结。为补充现有文献,本综述涵盖了前述AI模型的理论发展,以及42个近期AI在药物设计中应用的详细总结。具体而言,其中13个利用GNN进行分子性质预测,29个使用RL和/或深度生成模型进行分子生成与优化。在大多数情况下,总结的重点是模型、其变体以及针对药物设计中特定任务的改进。此外,另有60个AI在分子生成与优化中的应用在表格中简要总结。最后,本综述对这些丰富应用进行了整体性讨论,从而使基于AI的药物设计中的任务、潜在解决方案与挑战变得清晰。

关键词

引用

@article{arxiv.2110.05478,
  title  = {An In-depth Summary of Recent Artificial Intelligence Applications in Drug Design},
  author = {Yi Zhang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2110.05478},
  year   = {2021}
}

备注

26 pages, 6 figures, 3 tables, 253 references