具有非平衡结合特性的肌醇三磷酸受体变构模型
生物大分子
2014-08-28 v2
摘要
肌醇三磷酸受体 (IPR) 是一种关键的离子通道,调节钙离子 (Ca) 从内质网 (ER) 流入细胞质。对 IPR 通道的深入研究有助于更好地理解钙振荡和钙波。长期以来人们观察到,IPR 通道是一个表现出适应性的典型生物系统。然而,近期关于适应性物理本质的进展表明,具有负反馈机制的适应性系统(如 IPR 通道)必须打破细致平衡,并始终在非平衡状态下运行且伴随能量耗散。几乎所有先前的 IPR 模型都是假设细致平衡的平衡模型,因此违背了适应性的物理本质。在本文中,基于从 \emph{Xenopus} 卵母细胞分离细胞核外膜上的 IPR 获得的膜片钳实验数据,我们构建了单 IPR 通道的非平衡变构模型。结果表明,我们的模型能较好地重现实验数据,并产生了正确的通道稳态和动态特性。特别是,我们的模型成功描述了高 [IP] 条件下平均开放持续时间对 [Ca] 的复杂双模依赖性,而这一稳态行为在先前的 IPR 模型中未能得到正确描述。最后,我们利用膜片钳实验数据验证了 IPR 通道确实打破了细致平衡,因此是一个消耗能量的非平衡系统。
引用
@article{arxiv.1311.2665,
title = {An allosteric model of the inositol trisphosphate receptor with nonequilibrium binding},
author = {Chen Jia and Daquan Jiang and Minping Qian},
journal= {arXiv preprint arXiv:1311.2665},
year = {2014}
}
备注
23 pages, 5 figures