再论多价性:多位点磷酸化与底物再结合的分析
亚细胞过程
2009-11-13 v4 分子网络
摘要
利用多个磷酸化位点来调节生物反应在细胞信号传导中无处不在。如果每个位点贡献一个额外的、等价的结合位点,那么磷酸化数量增加的一个后果可能是增加配体在解离后立即重新结合到其受体的概率。此类效应如何影响细胞信号传导系统尚未得到充分研究。在此,我们采用用于配体再结合的自洽积分方程形式体系,结合蒙特卡洛模拟,进一步研究了多个等价结合位点对塑造生物反应的影响。预测了多个因再结合效应的不同普遍性而表征出定性不同物理机制的区域。计算表明,当配体再结合对剂量反应有显著贡献时,纯粹的多价模型可以非线性地影响结合曲线。该模型还预测,仅凭配体再结合本身似乎不足以产生高度协同的生物反应。
引用
@article{arxiv.0706.2383,
title = {Allovalency revisited: an analysis of multisite phosphorylation and substrate rebinding},
author = {Jason W. Locasale},
journal= {arXiv preprint arXiv:0706.2383},
year = {2009}
}
评论
44 pages, 5 figures; accepted Journal of Chemical Physics