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基于Wasserstein距离的密度图对齐

图像与视频处理 2024-03-13 v2 定量方法 机器学习

摘要

本文针对冷冻电镜应用背景下的三维物体以密度图表示时的对齐问题,提出一种算法。该算法基于在刚体变换后最小化密度图之间的1-Wasserstein距离。所诱导的损失函数相比其欧氏对应项具有更平缓的优化地形,并采用贝叶斯优化进行计算。数值实验显示,在真实蛋白质分子的对齐上,相较现有算法取得了更高的精度与效率。在异质对对齐的情境下,我们说明了对于新距离函数的潜在需求。

关键词

引用

@article{arxiv.2305.12310,
  title  = {Alignment of Density Maps in Wasserstein Distance},
  author = {Amit Singer and Ruiyi Yang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2305.12310},
  year   = {2024}
}