小分子力场方法用于低能构象预测的令人警醒的评估
化学物理
2017-08-15 v2
摘要
我们开展了一项大规模计算研究，以评估常见小分子力场在典型有机分子低能构象计算筛选中的效用。通过对700种不同分子结构中多达250个多样构象的能量和相对排序进行统计分析，我们发现广泛使用的经典力场（MMFF94、UFF和GAFF）的能量与在PM7和DFT优化几何下计算的半经验（PM7）和Kohn-Sham密度泛函理论（DFT）能量之间，无条件地表现出较差的能量和排序相关性。相比之下，半经验PM7计算与DFT计算显示出显著更好的相关性，且几何结构通常更优。基于这些结果，我们提出了更可靠地进行构象筛选的建议。
引用
@article{arxiv.1705.04308,
title = {A Sobering Assessment of Small-Molecule Force Field Methods for Low Energy Conformer Predictions},
author = {Ilana Y. Kanal and John A. Keith and Geoffrey R. Hutchison},
journal= {arXiv preprint arXiv:1705.04308},
year = {2017}
}
备注
20 pages, 8 figures