基于 DFT 的磷脂分子 (DMPC) 构象分析
其他凝聚态物理
2008-06-05 v1 软凝聚态物质
摘要
利用密度泛函理论 (DFT) 并辅以阻尼经验色散能项 (DFT-D)，研究了肉豆蔻酰磷脂酰胆碱 (DMPC) 分子的构象空间。发现了 14 个基态异构体，其总能量差异小于 1 kcal/mol。尽管它们的扭转角组合存在差异，但这些构象异构体均具有共同的几何轮廓，包括特定原子基团之间及内部的吸引力、排斥力和约束力的平衡。该轮廓的定义与从 DMPC 溶液测得的 NMR 性质推导出的大多数结构特征相符。计算得到的分子振动谱与 DMPC 双分子层的实验数据吻合良好。这些结果支持了 DMPC 分子在各种组装体中保持其独立分子结构的观点。
引用
@article{arxiv.0806.0774,
title = {DFT-based Conformational Analysis of a Phospholipid Molecule (DMPC)},
author = {S. Krishnamurty and M. Stefanov and T. Mineva and S. Begu and J. M. Devoisselle and A. Goursot and R. Zhu and D. R. Salahub},
journal= {arXiv preprint arXiv:0806.0774},
year = {2008}
}
备注
31 pages, 6 Tables, 4 Figures