单链平均场理论内流体相磷脂双分子层的通用模型
软凝聚态物质
2014-05-19 v1
摘要
在单链平均场理论框架内，引入了一种针对饱和（DCPC, DLPC, DMPC, DPPC, DSPC）和不饱和（POPC, DOPC）磷脂的粗粒化模型。为 DMPC 双分子层调整的一组单一参数，足以描述一系列仅在疏水尾长度上不同的饱和脂质分子，以及尾部具有双键的不饱和（POPC, DOPC）磷脂的平衡和机械性质。双键被建模为固定 120 度角，而其余参数与饱和脂质保持一致。双分子层的厚度及其疏水核心、压缩率以及每个脂质的平衡面积均与每种脂质的实验测量值相符，并随尾长线性变化。该不饱和磷脂模型也能获取双分子层的主要热力学性质。该模型用于准确估算堆叠或多层中压缩或拉伸双分子层的自由能，并给出了合理的自由能估计值。所提出的模型可进一步用于研究脂质混合物、小分子包涵物以及双分子层与嵌入蛋白的相互作用。
引用
@article{arxiv.1405.4106,
title = {General model of phospholipid bilayers in fluid phase within the single chain mean field theory},
author = {Yachong Guo and Sergey Pogodin and Vladimir A. Baulin},
journal= {arXiv preprint arXiv:1405.4106},
year = {2014}
}