分子进化中替换数方差的一个简单通用结果
种群与进化
2016-02-17 v1 生物物理
基因组学
定量方法
摘要
在分子进化领域中，序列进化过程中发生的替换（核苷酸、氨基酸等）次数是一个具有根本重要性的随机变量。尽管对于给定的替换模型可以估计序列分子进化的平均替换数，但该随机变量的方差不存在简单的求解方法。我们在本文中表明，对于短时间以及长时间，方差的计算与平均替换数的计算同样简单。除其根本重要性外，该结果可用于研究离散指数 R，即方差与平均替换数之比，这在分子进化的中性理论中极为重要。通过研究大类替换模型，我们证明尽管 ，但一般而言要获得显著大于1的 R 需要对替换模型的结构附加额外假设。
引用
@article{arxiv.1602.05175,
title = {A simple, general result for the variance of substitution number in molecular evolution},
author = {Bahram Houchmandzadeh and Marcel Vallade},
journal= {arXiv preprint arXiv:1602.05175},
year = {2016}
}