RNA 及类 RNA 聚合物前生物聚合的加聚模型
化学物理
2020-04-27 v3 统计力学
生物物理
生物大分子
摘要
RNA 世界假说隐含的前提是,前生物 RNA 合成尽管发生在无生化催化剂的环境中,却产生了对生命形成至关重要的长 RNA 聚合物。为研究长 RNA 聚合物的前生物形成,我们考虑一类通用溶液,其中功能相同的单体单元能够通过逐步增长过程成键形成线性聚合物。在(1)溶液充分混合且(2)成键/断键速率与聚合状态无关的假设下,各长度聚合物的浓度遵循几何 Flory-Schulz 分布。我们考虑产生此平衡的速率动力学;将速率动力学、成键吉布斯自由能与成键概率相联系;针对 Flory-Schulz 初始条件的代表性特例以封闭形式求解动力学;并展示施加最大聚合物长度限制的影响。随后,我们推导出截断所引入误差的下界,并将该下界与模拟中实际误差进行比较。最后,我们提出将这些理论预测与实验结果相联系的方法。
引用
@article{arxiv.1910.11484,
title = {A Polyaddition Model for the Prebiotic Polymerization of RNA and RNA-like Polymers},
author = {Alex Spaeth and Mason Hargrave},
journal= {arXiv preprint arXiv:1910.11484},
year = {2020}
}