开放图像数据格式与存储库的全球标准概览
其他定量生物学
2020-10-21 v1
摘要
生物与生物医学成像数据集记录了生物有机体在多个时空尺度上的构成、结构与动态。成像技术现已贯穿于生命与生物医学科学的各个领域，用于基础科学中生物机制的发现与理解，以及临床试验、动物与人体医学中的评估、诊断与治疗干预。成像的普遍应用带来了一个重要的问题与机遇：生物与医学成像数据的价值与最终归宿是什么？近年来，若干信息学与数据科学技术已足够成熟，使得这些数据集的常规发布成为可能。来自15个国家及所有有人居住大陆的 Global BioImaging 参与者一致认同，有必要为建立图像数据存储库及其向全球科学界提供数据所采用的格式制定建议与指南。本白皮书提出了这些通用、全球适用指南的准则共识，以及当前可用、能为未来发展奠定基础的开放工具与资源的暂定提案。
引用
@article{arxiv.2010.10107,
title = {A Global View of Standards for Open Image Data Formats and Repositories},
author = {Jason R. Swedlow and Pasi Kankaanpää and Ugis Sarkans and Wojtek Goscinski and Graham Galloway and Ryan P. Sullivan and Claire M. Brown and Chris Wood and Antje Keppler and Ben Loos and Sara Zullino and Dario Livio Longo and Silvio Aime and Shuichi Onami},
journal= {arXiv preprint arXiv:2010.10107},
year = {2020}
}