一种用于查找近似最长公共子串的快速且简单的 $O (z \log n)$ 空间索引

Nick Fagan; Jorge Hermo González; Travis Gagie

一种用于查找近似最长公共子串的快速且简单的 $O (z \log n)$ 空间索引

数据结构与算法 2022-12-06 v2

作者: Nick Fagan , Jorge Hermo González , Travis Gagie

摘要

我们描述了在给定文本 $T [1..n]$ 和正常数 $\epsilon$ 的情况下，如何构建一个简单的 $O (z \log n)$ 空间索引，其中 $z$ 是 $T$ 的 LZ77 解析中的短语数，使得随后在给定模式 $P [1..m]$ 时，能在 $O (m \log \log z + \mathrm{polylog} (m + z))$ 时间内并以高概率找到一个出现在 $T$ 中的 $P$ 的子串，其长度至少为 $P$ 与 $T$ 的最长公共子串长度的 $(1 - \epsilon)$ 倍。

关键词

最长公共子串近似匹配空间高效索引 LZ77 解析文本索引模式匹配

引用

@article{arxiv.2211.13434,
  title  = {A fast and simple $O (z \log n)$-space index for finding approximately longest common substrings},
  author = {Nick Fagan and Jorge Hermo González and Travis Gagie},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2211.13434},
  year   = {2022}
}

一种用于查找近似最长公共子串的快速且简单的 $O (z \log n)$ 空间索引

摘要

关键词

引用

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