抗体-抗原构象统计力学的计算研究

我们将免疫球蛋白分子抗原结合位点与抗原分子间的化学亲和力表示为两分子以结合态存在的概率。我们的模型基于在联合抗体/抗原结合位点序列的构型空间中识别形状吸引子。我们以Ramachandran角参数化构型空间。形状吸引子使我们能构造一条马尔可夫链，其稳态分布给出所需的附着概率。由此我们得以描绘亲和力的焓、熵与动力学组分并研究其相互作用。