细胞同步实验中流式细胞术和出芽指数测量的分支过程模型
应用统计
2010-09-30 v1
摘要
我们提出了一个灵活的分支过程模型，用于研究重要细胞过程的同步/时间序列实验中的细胞群体动态。其公式是建设性的，基于对群体中独特队列随时间出现和演变的核算，从而可以写成闭式形式。该模型可以将效应归因于群体的子集，提供了历史上应用于这些群体的模型所不具备的灵活性。它为群体的计算机模拟同步提供了工具，并可用于反卷积群体水平的实验测量，例如时间表达谱。它还允许直接比较来自多个实验的检测测量结果。该模型可以拟合出芽指数或DNA含量测量数据，或两者兼有，并且易于适应新形式的数据。使用DNA含量数据的能力使该模型几乎适用于任何生物体。我们描述了该模型，并在一项关于酿酒酵母细胞周期进程的研究中说明了其实用性和灵活性。
引用
@article{arxiv.1009.5745,
title = {A branching process model for flow cytometry and budding index measurements in cell synchrony experiments},
author = {David A. Orlando and Edwin S. Iversen and Alexander J. Hartemink and Steven B. Haase},
journal= {arXiv preprint arXiv:1009.5745},
year = {2010}
}
备注
Published in at http://dx.doi.org/10.1214/09-AOAS264 the Annals of Applied Statistics (http://www.imstat.org/aoas/) by the Institute of Mathematical Statistics (http://www.imstat.org)