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具有统计几何对称性的异质病毒颗粒三维重建

定量方法 2016-11-22 v1 生物大分子

摘要

在三维重建问题中,从冷冻电子显微镜获得的图像数据是所研究对象(例如病毒)的许多异质实例的投影。当对象是异质的但具有整体对称性时,将其描述为具有对称统计的随机对象是很自然的。本文提出了一种最大似然重建方法,该方法允许每个对象缺乏对称性,同时约束对象集合的统计具有对称性。该算法在噬菌体 HK97 上进行了演示,并与一种现有算法进行了对比,后者中每个对象虽然仍是异质的,但具有对称性。重建结果表明,所提出的算法消除了先前与对称轴相关的异质性计算中长期存在的畸变,并且提供的估计比现有算法的估计在生物学上更有意义。

关键词

引用

@article{arxiv.1611.06618,
  title  = {3D Reconstruction of Heterogeneous Virus Particles with Statistical Geometric Symmetry},
  author = {Nan Xu and Peter C. Doershuck},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1611.06618},
  year   = {2016}
}