用于病毒 3D 光学成像的二十面体壳层解析模型
生物物理
2014-08-08 v1
摘要
带有内含物的调制二十面体壳层是对许多病毒（包括最近发现的大型双链 DNA 病毒）的简洁描述。此类病毒的许多 X 射线散射图样显示出主要的多边形条纹，这可以通过均质二十面体壳层的图像重建来复现。关于低分辨率重建的一个关键问题是如何仅用少数几个参数以高效的方式引入对 3D 轮廓的进一步改变。在此，我们推导并汇编了此类物体的不同解析模型，同时考虑了实际的光学装置和此类病毒的典型结构。此类模型的优势包括：1) 固有地过滤和抑制离散网格的不同数值误差；2) 为高通量分类/排序和更高分辨率的累积重建提供一组简洁且有意义的特征提取描述符；3) 将（物理）分辨率与（数值）离散化步长解耦，并具有用于任意尺度可视化或进一步分析的矢量图形格式；4) 消除相位检索步骤，并在实空间公式中强制实施透明、相关且受控的先验信息类型/水平；以及 5) 评估二十面体物体的反射和表面共振，从而对常见的散射模型进行修正。
引用
@article{arxiv.1408.1582,
title = {Analytical models of icosahedral shells for 3D optical imaging of viruses},
author = {Aliakbar Jafarpour},
journal= {arXiv preprint arXiv:1408.1582},
year = {2014}
}