为何应在衰老研究中运用拓扑数据分析：迈向定义“衰老的拓扑形状”
其他定量生物学
2020-08-21 v1
摘要
生命系统受制于时间之箭；自出生起，它们经历复杂的转化（自组织）以持续求生，但衰老与疾病不可避免地将其引向死亡。衰老能否被理解并最终逆转？可采用哪些工具以深化对衰老的理解？本文邀请生物学家与临床医生思考一些关键的概念性思想与计算工具（数学家与物理学家已知），其潜在有助于剖析衰老与疾病的某些潜在过程。具体而言，我们首先讨论如何对复杂系统进行分类与分析，并强调使复杂系统难以研究的重大理论困难。随后，我们介绍拓扑数据分析——一种新颖的大数据工具——其可能因通过拓扑考量以整体方式从数据中提取知识而有助于复杂系统的研究。这些概念性思想与工具以颇为非正式的方式讨论，以为研究衰老的数学家与生物学家之间的未来探讨与合作铺路。
引用
@article{arxiv.2008.09039,
title = {Why we should use Topological Data Analysis in Ageing: towards defining the "Topological shape of ageing"},
author = {Tamàs Fülöp and Mathieu Desroches and Fernando Antônio Nóbrega Santos and Serafim Rodrigues},
journal= {arXiv preprint arXiv:2008.09039},
year = {2020}
}