全切片图像到 DICOM 转换的事件驱动云基础设施
分布式、并行与集群计算
2022-03-29 v1
摘要
医学数字成像与通信（Digital Imaging and Communication in Medicine, DICOM）规范正日益被数字病理学采用，以促进数据标准化与互操作性。将专有文件格式高效转换为 DICOM 标准格式是机构采用 DICOM 的关键要求，对于确保与现有扫描仪、显微镜和数据存档的兼容性必不可少。在此，我们提出了一种用于 DICOM 转换的云计算架构，利用托管于 Google Cloud 无服务器计算环境中的事件驱动微服务框架，以实现从单个图像到机构规模数据集的高效 DICOM 转换。在我们的实验中，采用基于微服务的方法相较并行与串行处理大幅减少了处理一批图像的运行时长。本工作展示了设计可扩展系统以实现数字病理工作流企业级采用的重要性，并为使用微服务架构实现高效 DICOM 转换提供了蓝图。
引用
@article{arxiv.2203.13888,
title = {Whole Slide Image to DICOM Conversion as Event-Driven Cloud Infrastructure},
author = {David Brundage and Jacob Rosenthal and Ryan Carelli and Sophie Rand and Renato Umeton and Massimo Loda and Luigi Marchionni},
journal= {arXiv preprint arXiv:2203.13888},
year = {2022}
}