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全基因组建模准确预测植物数量性状

种群与进化 2015-11-10 v1

摘要

理解基因组变异与数量性状(如生理、产量、适合度或行为)表型变异之间的关系,将为预测适应性进化和育种方案提供重要见解。一个特定问题是,影响数量表型的遗传变异通常是一个或两个解大效应的突变所致,还是多个小效应突变的结果。本文利用野生模式豆科植物蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)探讨此问题。我们表明,诸如数量抗病性之类的表型可利用全基因组渐混模式很好地预测,由此推断必然存在许多小效应突变。我们的发现证明了新颖的“全基因组建模”——WhoGEM——方法的潜力,并首次通过实验验证了无穷小模型作为植物数量表型适应性进化的机制。该见解可加速育种和生物医学研究计划。

关键词

引用

@article{arxiv.1511.02514,
  title  = {Whole-genome modeling accurately predicts quantitative traits in plants},
  author = {Laurent Gentzbittel and Cecile Ben and Melanie Mazurier and Min-Gyoung Shin and Martin Triska and Martina Rickauer and Yuri Nikolsky and Paul Marjoram and Sergey Nuzhdin and Tatiana Tatarinova},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1511.02514},
  year   = {2015}
}