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用于三维分子结构相似性度量的加权 Tanimoto 系数

计算机视觉与模式识别 2018-06-15 v1

摘要

分子结构相似性搜索是化学信息学中的重要应用,尤其在药物发现中。相似性搜索是用于分子结构识别的常用方法。它涉及相似性搜索的三个主要组成部分:结构表示、加权方案与相似性系数。本文基于加权欧几里得距离引入加权 Tanimoto 系数,以研究权函数对相似性搜索结果的影响。Tanimoto 系数是用于度量分子对之间相似性的常用相似性系数之一。多数研究领域发现相似性搜索基于二元或指纹数据。与此同时,我们使用非二元数据,并以安非他明结构作为参考或目标结构,其余数据集作为数据库结构。整个研究表明,带权与不带权的相似性搜索结果确实存在不同。

关键词

引用

@article{arxiv.1806.05237,
  title  = {Weighted Tanimoto Coefficient for 3D Molecule Structure Similarity Measurement},
  author = {Siti Asmah Bero and Azah Kamilah Muda and Yun-Huoy Choo and Noor Azilah Muda and Satrya Fajri Pratama},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1806.05237},
  year   = {2018}
}

备注

10 pages