化学空间中分子的精确采样
化学物理
2025-02-07 v2
摘要
分子相似性的概念出现在许多机器学习算法中，其基于这样的假设：具有相似表示的分子也将共享相似的性质。在这项工作中，我们提出了一种利用蒙特卡罗方法研究分子图空间中相似性度量的新方式。我们实现了从化学空间的底层分布中直接采样，而无需数值近似或完整枚举分子图，后者对于实际相关的感兴趣图集而言是不可处理的。该蒙特卡罗方法允许观察化学空间的若干有趣基本性质，例如化学空间中平均性质导数相对于感兴趣分子处性质值的线性趋势。该趋势在广延性质和强度性质中均被观察到，表明这一趋势是化学空间的固有属性。
引用
@article{arxiv.2309.09194,
title = {Exact sampling of molecules in chemical space},
author = {Jan Weinreich and Konstantin Karandashev and Guido Falk von Rudorff},
journal= {arXiv preprint arXiv:2309.09194},
year = {2025}
}