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WebCVTree4:面向原核生物的新型系统发育与分类学研究平台

种群与进化 2026-04-09 v1 基因组学

摘要

CVTree 是一种无比对的方法,用于推断物种系统发育和分类学。该方法允许基于整个基因组序列数据高效准确地解析大量物种之间的演化关系。自 2004 年起,我们持续提供 CVTree 网页服务。最近,服务器经历了重大的升级,最终推出了 WebCVTree4 平台。该升级包括对内置基因组数据库的全面更新。同时,核心算法经过优化,支持对上万种物种的在线系统发育重建,从而促进了基于基因组的生命树构建。此外,我们开发了一种新型算法,用于比较系统发育树与既定分类体系。这一算法允许快速树根定位、分类注释和树拓扑比较。通过基于交互式网页的可视化工具,用户可以动态调整树形布局并导出高质量的系统发育树图形。这一功能为比较 CVTree 生成的系统发育与分类提供了强大的支持。随着基因组测序成本不断下降,微生物演化研究和分类框架修订将越来越依赖整个基因组数据。WebCVTree4 将作为高效的基于网页的平台,支持微生物系统发育和分类学研究,可访问网址为 https://cvtree.online/。

关键词

引用

@article{arxiv.2604.06835,
  title  = {WebCVTree4: A Newly Designed Phylogenetic and Taxonomic Study Platform for Prokaryotes Using Composition Vectors and Whole Genomes},
  author = {Guanghong Zuo},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2604.06835},
  year   = {2026}
}

备注

21 pages, 3 figures