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Vis-SPLIT:用于 mRNA 表达分类的交互式层次建模

人机交互 2024-02-19 v1 定量方法

摘要

我们提出一种交互式视觉分析工具 Vis-SPLIT,用于将个体群体划分为具有相似基因特征的组。Vis-SPLIT 允许用户交互式探索数据集并利用视觉分离为特定癌症构建分类模型。可视化组件揭示基因表达与相关性,以辅助特定的划分决策,同时提供决策模型和聚类基因特征的概览。我们通过案例研究证明了框架的有效性,并与领域专家一起评估了其可用性。我们的结果表明,与现有分类系统相比,Vis-SPLIT 能够基于个体的基因特征对患者进行分类,从而有效洞察 RNA 测序数据。

关键词

引用

@article{arxiv.2309.04423,
  title  = {Vis-SPLIT: Interactive Hierarchical Modeling for mRNA Expression Classification},
  author = {Braden Roper and James C. Mathews and Saad Nadeem and Ji Hwan Park},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2309.04423},
  year   = {2024}
}

备注

To be published in IEEE Visualization and Visual Analytics (VIS), 2023